但是从表中可以看出，第2、第3、第10、第12师团的特设师团按照顺序是第13、第15、第17、第18师团的番号，这4个师团正是大正时期宇垣裁军被裁掉的师团，而现在被重建。步兵连队的番号也沿袭当初师团被取消时的番号。特设师团的火炮没有得到完全的装备，所以在步兵部队上作了补充和调整，完整的采用了4单位制（4个步兵连队），大约2万人的兵力。随着卢沟桥事变的爆发，许多常设师团和特设师团被依次动员起来，奔赴中国前线。第15和第17特设师团还是按照1939年3单位制（3个步兵连队）所临时编成的。在抗日战争爆发之后，除了常设师团和特设师团，许多新的师团被建立。
二十字号的师团（用剩余的步兵连队改编，增设的新师团）
常设师团由4单位制改为3单位制时，将剩余的一个步兵连队汇合，依此为基干编成的就是二十字号的师团。所以绝大部分是现役师团的精锐连队。而另外有由独立混成第11旅团改编的第26师团和由中国驻屯兵团改编的第27师团。这些师团的编成从1937年到1941年将近花了4年。但是第21和第22师团是完全新设立的师团，步兵连队也是在日本本土新招的，所以也不如正式的二十字号师团那么精干。
三十字号的师团（驻中国占领区的治安师团）
三十字号的师团是在1939年之后编成的。被动员的特设师团（4单位制）的官兵复员或师团解散的情况很多。三十字号的师团就是由这些特设师团新改编的。主要的任务是负责在维持中国占领区的治安，俗称为治安师团。第一次编成在1939年2月，第32到第37师团被编成；第二次编成在6月，编成的是第38师团到第41师团。步兵连队的番号从第210到第239共30个连队。师团编制要比常设师团稍微少，1万4千人左右，装备也要差一点。但是也有少数装备新式火炮的师团。
五十字号的师团（永久驻扎在满洲部队的补充兵）
第40、第41师团和三十字号的师团一样，作为“治安师团”而存在。但是四十字号的师团被编成是太平洋战争爆发以后的事了（第48师团比较特别），所以放到后面再阐述。
《昭和15年（1940年）军备改编要领》中规定，在满州的的兵力需要得到增强，来减轻苏联方面的压力。到1940年为止都是采取师团相互轮换的方式，向满州派遣兵力的。而在《要领》中取消了这种“换班”的方式，采取了派遣永久驻扎在满州的部队的最终方式。这是因为吸取了张鼓峰和诺门坎事件的教训。永久驻扎的师团，由第1、第8至第12、第14、第16师团和新设置的五个二十字号的师团所编成，共计13个师团。作为各个常备师团的在本土的留守师团，五十字号的师团（丛第51到第57师团）而此应运而生。师团的步兵连队番号的采用很复杂。编成担当的常备师团、特设师团的连队番号或是大正时期裁军后没有被重建的连队番号都是五十字号师团的步兵连队的选择。
五十字号的师团正式编成是在1940年7月。但是第16师团（京都）没有被派往满州，相反它的留守师团第53师团被派往满州。而第16师团在第53师团编成的当日（1941年9月初）立即被派往南太平洋去参加攻打菲律宾的作战。五十字号的师团的编成是为了比平时培养更多中下级军官、加强补充兵的训练和教育。而师团编制和装备只是通常师团的三分之二。
太平洋战争爆发到无条件投降
四十字号的师团（以动员为目的的常设师团）
第40和第41师团作为治安师团被编成前面已经提到了。而四十字号师团的主力编成是在1943年。1942年共有57个师团，再加上14个增设的师团共计71个师团的计划在1943年初被通过。这个计划叫做《1943年综合作战指导、兵力运用以及军备大纲》。前面已经讲述过了，五十字号的师团是3单位制（3个步兵连队），而留守师团和原来的常设师团都是4单位制（4个步兵连队）。这样就有8个步兵连队多了出来，再加上第61到第67独立步兵团，以此为基本兵力就建立了四十字号的师团（只有第61独立步兵团被改编为留守第61师团）。总之，第62到第67独立步兵团变成了第42到第47师团。
但是也有例外。第61独立步兵团就变成了第61师团。还有第65独立步兵团被改编成了第65旅团之后立即被派往太平洋战场，没有向上升格编为师团。也就是说第45师团这个番号一直是空着的。还有第48师团，在1940年以台湾混成旅团（武汉会战时的波田支队的原型，支队长：波田重一少将）为基干，再加上第6师团的一个步兵连队所组成，其实质和二十字号的师团是一样的。
六十字号的师团
六十字号的师团是在1942、1943年，在中国战场的独立混成旅团所改编的。其性质和三十字号的师团一样，属于“治安师团”的一类。1942年，第58到第60、第68到第70这6个师团被编成。1943年，第62到第65这4个师团被编成。第61到67师团的番号都空置着。原来准备用本土的第61到第67独立步兵团来改编的，但是像前文所说的，都改编成了四十字号的师团。六十字号的师团兵力约1万2千人，步兵旅团2个，独立步兵大队8个，另配有师团工兵、通信、辎重部队，但是没有炮兵部队。
