2003年11月15日，美国警方对涉嫌1996年亚特兰大奥林匹克公园爆炸案的在逃犯埃里克?鲁道夫的调查工作已基本完成，事实清楚，证据确凿。美国司法部向他正式提出诉讼。

起诉书列举了鲁道夫所犯的21条罪名，除包括制造奥林匹克公园爆炸案外，还有1997年1月在亚特兰大市制造另两起恶性爆炸案。据报道，起诉书由亚特兰大的一个联邦大陪审团完成，指控鲁道夫犯有恶意使用爆炸物、在进行暴力犯罪时使用破坏性装置、跨州运输爆炸物以及通过电话发出炸弹爆炸威胁等众多罪名。

2005年7月18日，伯明翰法庭正式开庭审判鲁道夫。

当天早晨，穿着一身红色囚衣的鲁道夫一走进法庭，行为甚为嚣张。他冲着公诉人眨了眨眼睛，一副毫不在意的样子。这话时候，人们这才一睹鲁道夫的容貌：中等身材，体格健壮，眼窝深陷，眯缝眼睛，额发早谢。

面对法官的提问，鲁道夫一概用简短的语句回答。当公诉人描述案发现场细节的时候，鲁道夫索性开始用指尖在桌面上有节奏地敲打起来。

对于自己1998年1月29日在伯明翰“新女性全女子卫生保健中心”外所制造的爆炸案，鲁道夫毫不掩饰其嘲弄的语气说道：“尊敬的阁下，那的确是我干的。”

这是他首次为其名下的一系列爆炸案正式认罪。

随后，鲁道夫就被警察送上飞机，前往亚特兰大。按照“认罪求情协议”，他将继续承认包括“奥林匹克公园爆炸案”在内的其他3桩血案。

8月13日下午，鲁道夫出现在佐治亚州首府亚特兰大的法庭上。这次他仿佛变了一个人，面无表情、平静而礼貌地回答问题，承认自己制造了奥林匹克公园爆炸血案。

鲁道夫的律师代表他向媒体散发了一份声明。他在声明中说，选择亚特兰大夏季奥运会作为袭击目标，是因为美国政府允许自愿性堕胎。他想通过爆炸事件激怒美国政府，让其在全世界面前丢脸。

鲁道夫说，自己虽然认罪，但毫无悔意，因为自己的行为代表正义。他不是无政府主义者，大体上他也不反对政府和执法机关，但认为堕胎是一种谋杀，而阻止堕胎的势力是正义的。因为美国政府使谋杀孩子合法化，他不效忠于这个政府，也不承认这一政府的合法性。

健康护理中心的业主代表护士埃米莉?莱昂斯和罗伯特?桑德森警官遗孀在法庭上提出，希望鲁道夫能招供出参与爆炸案的其他嫌疑犯。

公诉人表示，鲁道夫坚称自己是血案的唯一凶手。

当鲁道夫的认罪之言一出，受害人埃米莉?莱昂斯随即在法庭前排掩面啜泣。她稍后对媒体说道：“我一直期待着他接受审判的那一天。现在听起来他很为自己的所作所为自豪。这才是真正让人受伤的地方。”

根据此前达成的“认罪求情协议”，鲁道夫可以免于被判处死刑，因此，亚特兰大联邦法院判处鲁道夫终身监禁。

在法庭宣判的时候，鲁道夫公开表示对受害人及其家属道歉，但却仍然不改自己的极端保守主义信仰：“我真诚地希望能够在不伤害无辜平民的情况下达到自己的目的。”

对于帮助他免于死刑的辩护律师，鲁道夫在法庭上戏谑道：“他们真的是非常非常好、最棒最棒的律师。”

莱昂斯在法庭之外表示，她对鲁道夫得以逃脱死刑感到恶心。

她说，“我们一直都觉得，只有死刑才能让他罪有应得。量刑应该依据罪行大小。这真让人感到恶心。”