当故事到达尾声，回望过去的小智是否对过往抱有遗憾，即使是站在了神奇宝贝大师的巅峰，他也对过去存在难以释怀之物。 在得到阿尔宙斯帮助，回溯时间，一切重启，带着前世的记忆以及阿尔宙斯的礼物的小智能否在登上神奇宝贝大师之巅的路上实现更加美满的旅途。 “现在，站在你面前的是收揽所有冠军，不留任何遗憾，来自真新镇的小智，未来的神奇宝贝大师！” （多人重生，并且与原剧有部分设定改变，增加部分游戏和特别篇人物