1937年（民国二十六年）7月7日卢沟桥事变发生，全国军民奋起抗战。

8月5日阎司令赴南京参加最高国防会议，表示拥护全面抗战，受任第二战区司令长官，当月国共第二次合作达成协议，红军改编为国民革命军第八路军（后改称第十八集团军），编入第二战区战斗序列，进入山西作战，国共合作在山西进行抗战的局面形成。

日本侵略军占领平津后，其一路指向山西。

阎司令于8月27日亲赴雁门关内的太和岭口指挥作战。

9月初，日军侵入山西，晋绥军在天镇和广灵未能阻敌前进。

9月下旬，国共两党军队配合进行了平型关战役，八路军歼敌1000余人，取得抗战以来的首次胜利，给抗日军民以极大鼓舞。

晋绥军与**军共同扼守忻口，与敌展开大规模战斗，忻口国军坚守23天，予敌重创，在战略上具有重大意义，但由于娘子关失守、国军后路有被切断之虞，忻口国军被迫撤退。

由于敌强我弱，11月8日晋原失守。

在此之前，阎司令的抗日决心有目共睹，晋省成为全国实现国共合作、坚持抗战的模范地区，并为晋省赢得了“抗战模范省”的美誉。

1938年2月，日寇大举南侵，阎司令经吉县渡过黄河到陕西宜川县秋林镇避难。

在八路军、抗战决死纵队和晋绥军的顽强抵抗、坚决打击下，日军被迫退缩于铁路沿线和平原地带，广大山区成为抗日军民的根据地，**领导的晋绥、晋察冀、晋冀鲁豫边区相继成立。

4月日军停止对山西国民党军队的追击，山西战局趋于稳定，先于全国进入战略相持阶段。

可是，临汾失守后，阎司令眼看着自己苦心经营多年的晋省大半沦于敌手，他的思想发生了巨大变化，旧军阀视地盘为自家私产的本性暴露出来了，他对八路军、决死纵队的发展，开始顾虑重重、处处掣肘了。

阎司令由此开始走上积极制造**摩擦的道路。

1938年7月、9月，阎司令连续两次在吉县古贤村秘密召开晋绥军高级将领会议，密谋秘密“扶旧军队”、公然压制以抗日决死纵队为代表的新军队，扬抑的标准只有一个：是否对阎司令个人忠心。

此时的阎司令已经不再把主要精力用于对日作战上了，而是一心排斥异己，还要把晋省变成他个人的晋省。

肖玉兰就是在这个危机四伏的时候，来到了晋绥军。

虽然肖玉兰送来的情报，“救”了阎司令一命，虽然肖玉兰也是晋省人，但生性多疑的阎司令并没有把她安排进要害的机要部门，而是把她安排到自己最信任的“五姑娘”阎慧卿手下，成为阎司令办公室新设的电讯科科长。

虽然肖玉兰还是负责阎司令与外界的电报收发工作，但这完全是纯官方公开往来的电报，有时候甚至是发表一些阎司令的明码通电，表面上看起来地位不低，实际上根本接触不到阎司令的核心机密。